WAcrocera orbicula – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich i rodziny opękowatych.
WChalarus spurius – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich i rodziny Pipunculidae.
Chyromya oppidana – gatunek muchówki z rodziny Chyromyidae.
WCoproica ferruginata – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.
WCopromyza equina – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Copromyzinae.
WCopromyza stercoraria – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Copromyzinae.
WCuchna nawozowa – gatunek owada z rzędu muchówek.
WDiastata vagans – gatunek muchówki z rodziny Diastatidae i podrodziny Diastatinae.
WDoskwier pastwiskowy – gatunek muchówki z rodziny komarowatych. Niewielki, ciemno ubarwiony przedstawiciel rodziny. Występuje na wszystkich kontynentach z wyjątkiem Antarktydy i Ameryki Południowej, a także na licznych wyspach. Larwy rozwijają się w różnych zbiornikach słodkowodnych. Owady dorosłe migrują z miejsc rozrodu na znaczne odległości. Obie płcie żywią się nektarem, ale samice ponadto są agresywnymi hematofagami, ssącymi krew kręgowców, w tym ludzi. Gatunek jest wektorem wywołującej filariozę u psów Dirofilaria immitis, wywołującej tularemię Francisella tularensis oraz kilku arbowirusów.
WDrosophila busckii – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.
WDrosophila funebris – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.
Drosophila transversa – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.
WGnojka wytrwała – owad z rodziny bzygowatych. Długość 15-19 mm, barwy żółtawoszarej.
WGymnochiromyia flavella – gatunek muchówki z rodziny Chyromyidae.
WHeleomyza serrata – gatunek muchówki z rodziny błotniszkowatych i podrodziny Heleomyzinae.
WHermetia illucens – szeroko rozprzestrzeniony gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych (Stratiomyidae), opisany naukowo w 1758 roku przez Karola Linneusza pod nazwą Musca illucens. Owad hodowany jest przez wiele firm na skalę przemysłową jako alternatywne źródło białka i tłuszczu do celów paszowych i jako surowiec dla przemysłu chemicznego, wykorzystywany także w procesie remediacji biomasy. Gatunek typowy rodzaju Hermetia.
WKomar brzęczący, komar pospolity – występujący w krajach klimatu tropikalnego i subtropikalnego, także w klimacie umiarkowanym, gatunek owada z rodziny komarowatych (Culicidae), rzędu muchówek. Obok komara widliszka najbardziej rozpowszechniony komar na terenie Polski.
WKomar egipski – gatunek komara z rzędu muchówek (Diptera).
WKomar tygrysi – inwazyjny, szybko rozprzestrzeniający się gatunek owada z rodziny komarowatych (Culicidae), jeden z najbardziej rozpowszechnionych i najliczniej występujących komarów na całym obszarze Azji Południowo-Wschodniej, a jednocześnie najważniejszy z punktu widzenia mikrobiologii lekarskiej wektor, czyli gatunek roznoszący arbowirusy. Został zawleczony przez ludzi na inne kontynenty zagrażając ludziom takimi chorobami, jak chikungunya, denga, żółta febra, gorączka Zachodniego Nilu i japońskie zapalenie mózgu. W 1975 pojawił się na południu Europy i systematycznie przesuwa się na północ i zachód, zasiedlając kolejne kraje; w 2011 roku został stwierdzony w Bułgarii.
WKomarnica błotniarka – gatunek owada z rzędu muchówek (Diptera). Szkodnik żyjący w wilgotnych glebach, podgryzający korzenie roślin. Szkody wyrządzają larwy, które w nocy żerują na naziemnych częściach młodych roślin.
WKoziułka warzywna, komarnica warzywna, koziułkowiec – gatunek owada z rodziny koziułkowatych, często mylony z komarem widliszkiem. Uważany za szkodnika; występuje na glebach podmokłych i wilgotnych – wyrządza szkody wśród roślin przez podgryzanie korzeni i młodych roślin. Nieszkodliwy dla ludzi. Żyje od 4 do 6 dni.
WLeptocera fontinalis – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.
WLimosina silvatica – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.
WLotophila atra – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Copromyzinae.
WMicrochrysa polita – gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych i podrodziny Sarginae.
WMucha śrubowa - groźny pasożyt zwierząt i ludzi. Mucha śrubowa przypomina muchę domową jest jednak od niej trzy razy większa. Występuje na obszarze subtropikalnych krajów Ameryki Północnej i Południowej.
WNemopoda nitidula – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.
WNeoleria inscripta – gatunek muchówki z rodziny błotniszkowatych i podrodziny Heleomyzinae.
WNieżłop nakwietny – gatunek muchówki z rodziny bzygowatych i rodzaju Pipiza.
WPloniarka zbożówka, mucha szwedzka – gatunek owada z rodziny niezmiarkowatych (Chloropidae). Żeruje na roślinach wiechlinowatych i może powodować różnej wielkości straty, w zależności od zaatakowanego gatunku rośliny oraz pokolenia. Ograniczeniu jej liczebności sprzyja między innymi prawidłowa agrotechnika.
Plujka pospolita, nazywana też muchą niebieską – gatunek muchówki z rodziny plujkowatych, nekrofag.
WPollenia angustigena – gatunek muchówki z rodziny plujkowatych i podrodziny Polleniinae.
WPollenia rudis – gatunek muchówki z rodziny plujkowatych i podrodziny Polleniinae.
WRachispoda limosa – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.
Rachispoda lutosa – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.
WSaltella sphondylii – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.
Sargus bipunctatus – gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych i podrodziny Sarginae.
WSargus cuprarius – gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych i podrodziny Sarginae.
WScaptomyza flava – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.
WScaptomyza pallida – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.
Sepsis punctum – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.
WSernica pospolita – gatunek muchówki z rodziny sernicowate i podrodziny Piophilinae.
WSetacera breviventris – gatunek muchówki z rodziny wodarkowatych i podrodziny Ephydrinae.
WSphaerocera curvipes – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Sphaerocerinae.
WStrzyżak sarni, strzyżak jelenica – gatunek owada z rodziny narzępikowatych, rzędu muchówek. Pospolicie występuje na obszarach o klimacie umiarkowanym w Europie, północnych Chinach i na Syberii, został także zaintrodukowany do Ameryki Północnej.
WTephrochlamys rufiventris – gatunek muchówki z rodziny błotniszkowatych i podrodziny Heleomyzinae.
WThemira annulipes – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.
WThemira minor – gatunek muchówki z rodzinywońkowatych i podrodziny Sepsinae.
Themira putris – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.
WThoracochaeta zosterae – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.
WUdnica cebulówka – gatunek muchówki z rodziny bzygowatych i podrodziny Eumerinae.
WWszolinka pszczela, wesz pszczela, pszczołówka – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich, grupy łękorysych i rodziny wszolinkowatych.
WWywilżna karłowata, drozofila karłówka, muszka owocowa, wywilżnia, wywilżanka, drozofila, octówka – niewielki owad z rzędu muchówek. Jest gatunkiem należącym do bezkręgowych organizmów modelowych. Został użyty przez Thomasa Morgana w badaniach nad chromosomową teorią dziedziczności. Owad ten jest też jednym z pierwszych zwierząt wykorzystywanych w bioastronautyce – od 1952 w lotach balonowych w górne warstwy atmosfery – i pierwszym zwierzęciem umieszczonym przez ludzi w przestrzeni kosmicznej.
WZgniłówka pokojowa, muszka jesienna – gatunek muchówki z rodziny zgniłówkowatych. Owad kosmopolityczny, pospolity, tworzący populacje synantropijne. Larwy rozwijają się w rozkładającej się materii organicznej, mogą wywoływać muszycę.
Zwiesek okienny, tanecznica okienna – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich i rodziny zwieskowatych.