WPoniższa lista szkół wyższych i półwyższych w Japonii zawiera nazwy państwowych, publicznych i prywatnych uczelni japońskich, uszeregowanych według prefektur w układzie alfabetycznym.
WAkademia Cesarskiej Marynarki Wojennej – była szkołą przeznaczoną do kształcenia kadr dowódczych dla Cesarskiej Japońskiej Marynarki Wojennej. Powstała w Nagasaki, ale w roku 1866 przeniesiona została do Jokohamy, zaś w trzy lata później do Tsukiji, na ówczesnych przedmieściach Tokio. Ostatecznie, w roku 1888, znalazła swą siedzibę w Etajima, koło Hiroszimy.
WAkademia Obrony Narodowej Japonii – czteroletnia wyższa szkoła oficerska w Japonii w mieście Yokosuka, zajmująca się szkoleniem przyszłych oficerów wszystkich trzech rodzajów broni Japońskich Sił Samoobrony.
WAkita University – japońska uczelnia niepubliczna z uprawnieniami szkoły publicznej w mieście Akita, stolicy prefektury Akita.
WChiba University – japońska uczelnia państwowa w mieście Chiba, założona w 1949 roku.
WGunma University – japońska uczelnia państwowa w Maebashi, w prefekturze Gunma.
WHiroshima University – japońska uczelnia państwowa założona w 1949 roku.
WHitotsubashi University – japoński uniwersytet państwowy w mieście Kunitachi. Uczelnia została założona w 1875 roku.
WKumamoto University – japońska uczelnia państwowa założona w 1949 roku.
WKyoto University – jeden z najważniejszych japońskich uniwersytetów państwowych, znajdujący się w Kioto, drugi co do starszeństwa w Japonii. Stanowi państwową korporację uniwersytecką niezależną od rządu. Kształci się na nim około 22 tysięcy studentów.
WNagasaki University – japońska uczelnia państwowa w Nagasaki, z główną siedzibą w dzielnicy Bunkyō, utworzona w 1949 roku w wyniku połączenia kilku uczelni założonych przed II wojną światową.
WNagoya University – uniwersytet państwowy w Nagoi, w Japonii.
WOita University – japońska uczelnia państwowa w mieście Ōita, stolicy prefektury Ōita.
WOsaka City University – japońska publiczna uczelnia wyższa w Osace.
WOsaka University of Foreign Studies – utworzona w 1921 roku japońska uczelnia, która prowadzi edukację oraz badania języków świata i ich związków z kulturą. W roku 2007 została włączona do Osaka University. W skonsolidowanym Uniwersytecie działa „School of Foreign Studies, Osaka University”.
WUekusa Gakuen University – japońska uczelnia prywatna w mieście Chiba, w prefekturze Chiba.
WChuo University – prywatny uniwersytet rozmieszczony w pięciu kampusach usytuowanych w różnych częściach aglomeracji Tokio.
WUniwersytet Hokkaido – japońska uczelnia państwowa w Sapporo (Hokkaido). W zakres jej dydaktycznej i badawczej działalności wchodzą zagadnienia z wielu obszarów wiedzy, np. rolnictwa i rybołówstwa, medycyny, prawa, pedagogiki, nowoczesnych technik inżynierii i innych. W światowym rankingu uniwersytetów w roku 2010, Uniwersytet Hokkaido zajął 175. miejsce. W ramach badań naukowych Uniwersytet współpracuje z wieloma uczelniami na całym świecie. Jest macierzystą uczelnią laureata Nagrody Nobla w dziedzinie chemii, profesora Akiry Suzuki.
WUniwersytet Kiusiu lub w skrócie Kyudai – największy japoński uniwersytet państwowy na wyspie Kiusiu, w mieście Fukuoka.
WUniwersytet Meiji – japońska prywatna uczelnia wyższa.
WUniwersytet Osakijski – japoński uniwersytet państwowy z siedzibą w mieście Suita w prefekturze Osaka.
WUniwersytet Shinshū , w skrócie: 信大 (Shindai) – japońska uczelnia państwowa z główną siedzibą w Matsumoto, w prefekturze Nagano.
WUniwersytet Tohoku − jeden z prestiżowych, państwowych uniwersytetów w Japonii, z siedzibą w mieście Sendai, w prefekturze Miyagi. Posiada 10 wydziałów. W 2003 roku na uniwersytecie studiowało około 15 tys. studentów.
WTokai University – prywatny uniwersytet z główną siedzibą w Tokio, w Japonii.
WUniwersytet Tsukuba – japońska uczelnia publiczna.