WArsenał Królewski – budynek dawnego arsenału, założony w 1. połowie XVI wieku przez Zygmunta Starego wraz z odlewnią dział. Od początku XX wieku budynek wykorzystywany jest przez Uniwersytet Jagielloński. Arsenał Królewski położony jest przy ulicy Grodzkiej 64 na Starym Mieście w Krakowie.
WAuditorium Maximum – budynek Uniwersytetu Jagiellońskiego przy ulicy Krupniczej 33 w Krakowie, w bezpośrednim sąsiedztwie pochodzącego z lat 60. XX wieku Collegium Paderevianum. Wchodzi w skład tzw. II Kampusu UJ. Budynek stanowi zespół sal wykładowych, z których największa, sala amfiteatralna, może pomieścić 1200 osób. Decyzję o budowie podjęto w 2001, a budynek został oddany do użytku we wrześniu 2005. Łączny koszt budowy Auditorium Maximum wyniósł 43 mln zł, z czego 29 mln zł pochodziło z funduszy unijnych, 1 mln zł ze środków MENiS, a 13 mln zł ze środków własnych uczelni.
WBursa Długosza – nieistniejąca już bursa dla studentów Uniwersytetu Krakowskiego studiujących prawo kanonicze. Bursa zlokalizowana była przy Zakonie Jezuitów na ul. Grodzkiej 52–54 w miejscu obecnego ogrodu obok Collegium Broscianum. Została ufundowana w 1471 przez Jana Długosza, zlikwidowano ją w 1832, a zburzono w 1842–1843. W Collegium Maius zachowały się dwa portale i tablica erekcyjna z tej bursy.
WBursa Filozofów w Krakowie – nieistniejąca bursa, która stała przy ulicy Gołębiej, obok Bursy Jerozolimskiej, naprzeciw Collegium Minus. Tradycja mówi, że powstała po roku 1400 dla profesorów przybyłych z Pragi. Odnotowana w przekazach źródłowych w roku 1447 i 1474, a w 1488 jako zamieszkana przez studentów. W 1558 została odnowiona i powiększona staraniem biskupa płockiego Andrzeja Noskowskiego. Remontowana w XVII i XVIII wieku, w latach 1818–20 odnowiona i połączona z Bursą Jerozolimską. W 1841 spłonęła. Zburzona w 1869 w związku z planami budowy na jej miejscu Collegium Novum Uniwersytetu Jagiellońskiego.
WBursa Grochowa lub Bursa Ubogich Kanonistów – nieistniejąca już bursa dla ubogich studentów prawa kanoniczego Uniwersytetu Krakowskiego. Bursa zlokalizowana była przy ul. Kanoniczej 3.
WBursa Jagiellońska – dom studencki i hotel asystencki Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie, otwarty w 1976, usytuowany przy ul. Śliskiej 14 w starej części Podgórza.
WBursa Jeruzalem – nieistniejąca już bursa dla studentów Uniwersytetu Krakowskiego ufundowana przez biskupa krakowskiego, kardynała Zbigniewa Oleśnickiego.
WBursa Majętnych (Divitum) – nieistniejące już kolegium dla studentów Uniwersytetu Krakowskiego. Bursa Divitum, czyli bursa bogatych studentów, wzmiankowana była po raz pierwszy w 1428 r. Według przekazu Żegoty Pauliego miała powstać tuż po 1400 r. z fundacji Jana Stobnera. Zapewne przed tym rokiem na siedzibę bursy zaadaptowano starszą kamienicę, wzniesioną przed połową XIV w. w miejscu zachodniej piwnicy dzisiejszego Collegium Minus. Lokalizacja Bursy Divitum na działce Collegium Minus znajduje wyraźne potwierdzenie w zapiskach z lat 1474-1475.
WBursa Muzyczna – zabytkowa kamienica, zlokalizowana przy ulicy Grodzkiej na krakowskim Starym Mieście, mieszcząca na przełomie XVII i XVIII wieku bursę dla studentów Uniwersytetu Jagiellońskiego.
WBursa Sisiniego – zabytkowa kamienica na rogu ulic: Gołębiej i Jagiellońskiej w Krakowie, mieszcząca od początku XVII wieku do połowy XVIII wieku bursę dla studentów Uniwersytetu Krakowskiego.
WBursa Starnigielska – zabytkowa kamienica przy ulicy Gołębiej w Krakowie, mieszcząca od XVII wieku do pierwszej połowy XIX wieku bursę dla studentów Uniwersytetu Krakowskiego.
WBursa Śmieszkowska – nieistniejąca bursa dla studentów Uniwersytetu Krakowskiego, znajdująca się przy ulicy Jagiellońskiej w Krakowie od połowy XVII wieku do drugiej ćwierci XIX wieku.
WBursa Ubogich zwana także Bursą Jagiellońska – nieistniejące już pierwsze kolegium dla studentów Uniwersytetu Krakowskiego ufundowane przez Jana Isnera. Mieściła się w budynku na rogu ulic Gołębiej i Wiślnej zakupionym przez fundatora w 1409 r. Przeznaczona miała być głównie dla studentów z Litwy i Rusi studiujących filozofię i teologię. Na utrzymanie ubogich studentów, zajmujących tylną część domu, przeznaczano m.in. opłaty od bogatych studentów mieszkających od frontu. Około 1462 r. odnowił i rozbudował Bursę Ubogich Jan Długosz, zaś w 2 poł. XVI w. znaczną sumę na jej restaurację przeznaczyła królowa Anna Jagiellonka, dzięki czemu bursę zaczęto nazywać Jagiellońską. W 1786 r. budynek Bursy Ubogich przeznaczono na Bursę Chirurgów. W początkach XIX wieku znajdowały się tu koszary wojskowe co doprowadziło do znacznej dewastacji gmachu. Z powodu braku środków na odbudowę władze Uniwersytetu sprzedały budynek w 1838 r. Nowy właściciel rozebrał stare mury bursy i wybudował na jej miejscu klasycystyczna kamienicę.
WBursa Węgierska – istniejąca w latach 1464-1540 bursa dla węgierskich studentów Uniwersytetu Krakowskiego przy ul. Brackiej 5. Wcześniej, około 1460 mieszkał tutaj Jan Długosz. Obecnie na kamienicy znajduje się tablica upamiętniająca bursę.
WCentrum Edukacji Przyrodniczej – jednostka muzealno-dydaktyczna Uniwersytetu Jagiellońskiego, funkcjonująca na terenie III Kampusu UJ. Centrum gromadzi zbiory zoologiczne, geologiczne, antropologiczne i paleobotaniczne uniwersytetu, prezentowane do 2015 roku w czterech muzeach rozrzuconych na terenie miasta:Muzeum Zoologicznym, Muzeum Geologicznym, Muzeum Antropologicznym, Muzeum Paleobotanicznym.
WCollegium Broscianum – budynek Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie, położony przy ulicy Grodzkiej 52. Mieszczą się w nim instytuty filozofii, socjologii, religioznawstwa oraz Katedra Porównawczych Studiów Cywilizacji.
WCollegium Geologicum im. Mariana Książkiewicza – budynek Uniwersytetu Jagiellońskiego przy ulicy Oleandry 2a w Krakowie.
WCollegium Iuridicum Uniwersytetu Jagiellońskiego – jeden z najstarszych budynków Uniwersytetu Jagiellońskiego, znajdujący się przy ul. Grodzkiej 53 w Krakowie. Od południa przylega do placu św. Marii Magdaleny, od zachodu do ul. Kanoniczej.
WCollegium Kołłątaja – zabytkowy gmach Uniwersytetu Jagiellońskiego, zlokalizowany pomiędzy ulicami: św. Anny, Jagiellońską i Gołębią na krakowskim Starym Mieście.
WCollegium Maius – najstarszy budynek Akademii Krakowskiej, znajdujący się w Krakowie przy ul. Jagiellońskej 15, na rogu z ul. św. Anny.
WCollegium Minus – jeden z najstarszych gmachów Uniwersytetu Krakowskiego. Budynek ten to kamienica mieszczańska, usytuowana przy ulicy Gołębiej 11, którą w roku 1449 przejął Uniwersytet. Znajdowała się tutaj izba wspólna, lektoria i mieszkania profesorskie.
WCollegium Novum – zabytkowy, główny budynek Uniwersytetu Jagiellońskiego, oddany do użytku w 1887 roku, położony przy ulicy Gołębiej 24 przy Plantach.
WCollegium Nowodworskiego – budynek Uniwersytetu Jagiellońskiego położony przy ulicy św. Anny 12. Bartłomiej Nowodworski zapisał budynek na rzecz uniwersytetu z przeznaczeniem dla pierwszej świeckiej szkoły średniej istniejącej na uniwersytecie od 1586. Kolegium Nowodworskiego architektonicznie nawiązuje do późnogotyckiego Collegium Maius, a słynie z arkadowego barokowego dziedzińca.
WCollegium Paderevianum – budynek należący do Wydziału Filologicznego Uniwersytetu Jagiellońskiego, a znajdujący się przy al. Mickiewicza 9 w Krakowie.
WPałac Tadeusza Stryjeńskiego – zabytkowy pałac z lat 1882-1883, zaprojektowany przez Tadeusza Stryjeńskiego jako jego dom własny, położony przy ul. Batorego 12 w Krakowie.
WCollegium Śniadeckiego – budynek Uniwersytetu Jagiellońskiego znajdujący się przy ulicy Kopernika 27 w Krakowie.
WCollegium Witkowskiego – trójkondygnacyjny budynek przy ul. Gołębiej 13 w Krakowie, łączący elementy neogotyckie, neoromańskie i secesyjne. Budynek wzniesiono z przeznaczeniem na ówczesny Zakład Fizyczny Uniwersytetu Jagiellońskiego, obecnie ma w nim siedzibę Instytut Historii UJ.
WCollegium Wróblewskiego – zabytkowy gmach, zlokalizowany przy ulicy Karola Olszewskiego na krakowskim Starym Mieście.
WCollegium Zoologicum – modernistyczny gmach Uniwersytetu Jagiellońskiego, położony przy ulicy Romana Ingardena w Krakowie, w sąsiedztwie Parku Jordana.
WKampus 600-lecia Odnowienia Uniwersytetu Jagiellońskiego, zwany też III Kampusem – kampus Uniwersytetu Jagiellońskiego, powstały w pobliżu Pychowic i Osiedla Ruczaj-Zaborze w dzielnicy VIII Dębniki, w sąsiedztwie podstrefy specjalnej strefy ekonomicznej Krakowski Park Technologiczny. Budowa kampusu finansowana jest częściowo z budżetu państwa.
WPałac Larischa w Krakowie – zabytkowy pałac na rogu ulicy Brackiej 12–14 i placu Wszystkich Świętych 6. Obecnie jest własnością Wydziału Prawa i Administracji UJ.
WPałac Pusłowskich – willa znajdująca się w Krakowie, w dzielnicy I, przy ul. Westerplatte 10 na Wesołej.
WTheatrum Anatomicum, Katedra Anatomii Wydziału Lekarskiego UJ – budynek teatru anatomicznego, który powstał przy ul. Kopernika 12-14 w Krakowie w latach 1869-1872 według projektu Feliksa Księżarskiego dla Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego. Na frontonie budynku znajduje się zdobiony napis Theatrum Anatomicum. Ten początkowo jednopiętrowy budynek został rozbudowany o kolejną kondygnację dopiero po II wojnie światowej. W gmachu od samego początku jego istnienia znajduje się amfiteatralna sala wykładowa dla 200 studentów, stąd nazwa teatr anatomiczny. W budynku ma siedzibę Katedra Anatomii Wydziału Lekarskiego UJ.
WWilla Baszta zwana także Odyniec lub Zameczek – zabytkowy budynek znajdujący się w zachodniej części Krakowa, w Dzielnicy VII Zwierzyniec przy ul. Jodłowej 13a, w Przegorzałach.
WZamek w Przegorzałach – wybudowany w czasie II wojny światowej budynek w Przegorzałach, jedno z niewielu dzieł architektury III Rzeszy w Krakowie.